ガイドRNA設計
CRISPRdirect
パッケージ版

ライフサイエンス統合データベースセンター(DBCLS)の公開するウェブ版CRISPRdirectと同様の結果を自社内のコンピュータ上で得ることができるパッケージを提供
  • ゲノム編集のガイドRNAの設計に最適!
  • GGGenomeパッケージ版同梱!
  • デスクトップPC上で高速動作 Windows/Mac/Linuxに
    対応!

特長

特異性の高いガイドRNAの設計と選択が可能
CRISPRdirectは様々な生物種のゲノムに対してCRISPR-Cas9システムによるゲノム編集に利用可能な特異性の高いガイドRNA (gRNA)を設計することができます。
ガイドRNAのオフターゲット候補部位を検索することが可能
ガイドRNAの設計の際に検索できるデータベースは、350以上の生物種が対応可能です。(検索可能なデータベース一覧
独自のデータベースを追加可能
ガイドRNAの設計の際に検索できるデータベースは、自社で保有しているデータベースを追加する事も可能です。
ガイドRNAのオフターゲット候補部位を検索することが可能
ガイドRNAの設計の際に検索できるデータベースは、350以上の生物種が対応可能です。(検索可能なデータベース一覧

提供形態

CRISPRdirect 基本パック

CRISPRdirect本体+検索用データ(9種、12データベース同梱)
160万円(税別)


ゲノム
(9種)
(12データベース)
  • ヒト GRCh38/hg38 , hg19
  • マウスゲノム GRCm38/mm10
  • カニクイザルゲノム macFas5 ,  macFasRKS1912
  • マーモセットゲノム WUGSC 3.2/calJac3 , calJacRKC1912
  • アカゲザルゲノム BCM Mmul_8.0.1/rheMac8
  • ラットゲノム RGSC 6.0/rn6
  • ウサギゲノム Broad/oryCun2
  • ブタゲノム SGSC Sscrofa11.1/susScr11
  • イヌゲノム Broad CanFam3.1/CanFam3
ゲノム
(9種)
(12データベース)
  • ヒト GRCh38/hg38 , hg19
  • マウスゲノム GRCm38/mm10
  • カニクイザルゲノム macFas5 ,  macFasRKS1912
  • マーモセットゲノム WUGSC 3.2/calJac3 , calJacRKC1912
  • アカゲザルゲノム BCM Mmul_8.0.1/rheMac8
  • ラットゲノム RGSC 6.0/rn6
  • ウサギゲノム Broad/oryCun2
  • ブタゲノム SGSC Sscrofa11.1/susScr11
  • イヌゲノム Broad CanFam3.1/CanFam3

動作環境

Windowsの場合
  • Windows 10 Pro もしくは Windows 10 Enterprise, Windows 10 Educationの64bit版
  • Docker Desktop(2.2.0.5での動作を確認しております)
  • Hyper-Vの有効化(VMWareなどの仮想化ソフトと排他になる可能性があります)
  • メモリ: 16GB以上(Docker for Windowsに最低8GB以上割り当てる必要があります)

利用規約

お問い合わせ

株式会社レトリバ

株式会社レトリバは「AI技術でコトバの森を活用し、企業の生産性向上に貢献する」をミッションとし、数多くのソフトウェアを提供しております。自然言語処理、機械学習、深層学習をコアテクノロジーとしてコールセンターの問い合わせ分析、回答支援などを行うソリューションを提供しております。
東京都新宿区西新宿2-1-1 新宿三井ビルディング36階
info_bio@retrieva.jp